農產品檢測實驗室的建設重在設計。一體化設計，突出整體，兼顧特殊。應做到功能實用，以滿足當前和今后相當長一段時間的工作為條件，具有一定的可擴展性，特別是在水、電、通風等的負荷方面應有超前的考慮。實驗室使用者也應做設計師，和建筑物設計師一起完成實驗室的設計工作，首先要考慮設計的通用性，然后才是特殊要求。實驗室使用者在提出設計要求時，應在實驗室整體設計思路的指導下作細微的調整，以避免實驗室內部調整時無所適用的局面。

      農產品檢測實驗室的建設中應遵循“三個保護，兩個節約和一個確保”的原則，三個保護是要做到對人員的保護、對儀器設備的保護和對周圍環境的保護。兩個節約是在建設過程中節約資源，在使用過程中節約能源。一個確保是確保檢測結果準確可靠。農產品檢測實驗室一般為社會第三方公益機構，承擔著各方委托檢驗任務，通過國家相關部門的計量認證和審查認可，在結構布局上應首先滿足評審要求。農產品檢測實驗室因使用大量有機、無機化學試劑甚至劇毒化學物品而對環境有很大的污染性，因此實驗室建設應遠離居民區，而且實驗室的通風功能要好。