農產品檢測常用的方法是快速檢測和定量檢測，快速檢測屬于定性檢測。主要是使用簡便的儀器和方法對農產品檢測質量安全進行一般性檢測，具有成本低、速度快的特點，適用于現場檢測。快速檢測可作為對農產品檢測質量安全實施監督抽查的重要方法。快速檢測可以有效縮短檢測時間；由于農產品大多數是鮮活的，樣品不宜長時間保存，快速檢測可以做到對樣品的快速篩查，能有效解決樣品運輸保管難、儲存難的問題；快速檢測可以及時得到檢測結果，降低檢測費用。快速檢測也存在一些不足，主要是靈敏度低，容易出現假陽性，從而造成誤判。

      定量檢測主要在實驗室開展。是使用大型分析儀器和國標規定的方法對農產品檢測質量安全進行準確檢測，分辨率高，結果準確性具有保證。定量檢測工作量大，檢測周期較長，獲取結果的速度相對較慢，對檢測環境、條件的要求高，儀器設備、試劑耗材的使用率高，檢測成本相對較高。